能够使用「超级进化」的宝可梦很多，但目前 Pokémon GO 支援「超级进化」的暂时只有奇异花、喷火龙、水箭龟，牠们也会出现在超级团体战之中。未来会有更多宝可梦大针蜂、大比鸟支援「超级进化」，但未净化前的暗影宝可梦无法「超级进化」。

留意的是只限一只宝可梦进行「超级进化」，多于一只的话先前「超级进化」的宝可梦会打回原形。而「超级进化」过的宝可梦下次「超级进化」使用的「超级能量」减少。

在本作你只需「超级能量」就能让宝可梦「超级进化」，但商店仍然提供当年「超级进化」所需要的「GO超级手镯」作服装饰品。